(一)、高效液相色譜儀在石油化工領域的應用：
高效液相色譜分析儀在石油生產鑒定中占有重要的作用，在石油化工，農藥，環保等方面，經常采用薄層色譜法(TLC)和氣相色譜法(OC)進行含量測定，而液相色譜法(LC)只是用于對組分標樣的測定和分離的可能性的研究。近幾年來，HPLC在油品分析，尤其是在石油中多環芳烴、重質烴的測定方面取得了突破性的進展。以正己烷、二氯甲烷為流動相，用多維高效液相色譜技術及適宜的梯度，實現了烴族良好的分離和檢測。
(二)、高效液相色譜儀在生命科學領域的應用：
生命科學研究工作中，大的難題就是基因的解密工作，從基因組DNA序列尚不能回答某基因的表達時間、表達量、蛋白質翻譯后加工和修飾的情況、以及它們的亞細胞分布等等。現代蛋白質組的分析可嘗試使用第一向是體積排阻色譜的雙向HPLC高效液相色譜作預分離。高效液相色譜和雙向電泳將會成為蛋白質組學的重要分離工具。此外，在使用HPLC-MS測定人血漿中的依那普利及相對生物利用度和人體藥學動力學研究時，采用高效液相色譜質譜方法，電噴霧電離源正源選擇離子峰檢測，檢測效果明顯。
(三)、高效液相色譜儀在環境領域的應用：
西方發達國家將HPLC方法作為常用的環境監測方法。如美國EPA531方法，用高效液相色譜-熒光法測定飲用水中的N一甲基氨基甲酸酯殺蟲劑;EPA605方法用HPLC/電化學法測廢水中的聯苯胺類化合物;EPA8310方法用LC/熒光分析固體廢棄物中的多環芳烴，就連氣體中的有害有機物不少也是用HPLC測定。HPLC已在環境分析中得到廣泛應用，特別適用于低揮發性、分子量大、熱穩定性差的有機污染物質的分離和分析。如多環芳烴、酚類、多環聯苯、鄰苯二甲酸酯類、聯苯胺類、陰離子表面活性劑、有機農藥、除草劑等。
(四)、高效液相色譜儀在醫藥領域的應用：
近年來高效液相色譜法在藥物分析中占主要地位，據美國藥典22版載，HPLC在含量測定方法中位居第一。按照在藥物分析中的應用，高效液相色譜儀主要有四個作用：①分離分析藥物的組分含量：由于一種藥劑常含有多組分，色譜方法是既能分離又能定量的方法；②藥物生產中進行中間控制：生產抗菌素時，首先要了解發酵液中的主體與付產物的存在情況；③分析藥物在體內的殘量，這是近來研究新藥效能很主要的內容之一。如冬凌草甲素是植物中的一組分，有抗癌效果，但是毒性大，測定其在血清中含量很重要；④測定藥物在各種器官中的代謝產物，特別是研究藥物的代謝產物在血清中存在的情況。
(五)、高效液相色譜儀在食品領域的應用：
食品安全問題一直是所有消費者都共同關注的問題，隨著利益化的驅動，食品安全問題在近年來越來越突出，檢驗食品安全成為一項極為重要的程序。高效液相色譜法是食品檢測中具有代表性的一種方法，主要是針對食品中的碳水化合物、維生素、蛋白質、氨基酸、添加劑、激素、霉菌毒素、農藥殘留、獸藥殘留、無機成分等進行分析，保障食品安全。
綜上所述，高效液相色譜儀主要是采用新的科研技術，在化工生產和制藥上占有的水平，在生物化工、食品安全、醫學和環境等領域也獲得了廣泛的應用和推廣。與一般的檢測方法相比，高效液相色譜儀分析其特點是分析速度快、分離效率高、檢測靈敏度高、檢測自動化、適用范圍廣、組分易回收、樣品處理較簡單，具有更好的可行性和準確性。社會科技發展越來越迅速，對于物質的分析檢測更加看重，高效液相色譜分析不僅具有研究意義，還有相當長的發展前景。
